Neto memulai karier juniornya di klub Varzim kemudian memulai karier seniornya di klub tersebut. Sempat pindah ke Nacional sebelum bergabung dengan Siena pada tahun 2012.[2][3] Hanya bertahan selama satu musim di Siena, Neto melanjutkan kariernya di Zenit St. Petersburg sejak tahun 2013.[4][5] Ketika bermain dengan Zenit, Neto sempat dipinjamkan ke Fenerbahçe,[6] sebelum akhirnya bergabung dengan Sporting CP pada tahun 2019.[7]