La temporada 2012-13 de la 2. Bundesliga corresponde a la 39.ª edición de la Segunda División de Alemania. La fase regular comenzó a disputarse el 3 de agosto de 2012 y terminó el 19 de mayo de 2013.
Sistema de competición
Participaron en la 2. Bundesliga 18 clubes que, siguiendo un calendario establecido por sorteo, se enfrentan entre sí en dos partidos, uno en terreno propio y otro en campo contrario. El ganador de cada partido tiene tres puntos, el empate otorga un punto y la derrota, cero puntos.
El torneo se disputa entre los meses de agosto de 2012 y mayo de 2013. Al término de la temporada, los dos primeros clasificados ascenderán a la 1. Bundesliga, y el tercer clasificado disputará su ascenso con el antepenúltimo clasificado de la 1.Bundesliga. Los dos últimos descenderán a la 3. Liga y el antepenúltimo clasificado disputará su permanencia con el tercer clasificado de la 3. Liga.