El vicariato apostólico de Japón Meridional fue erigido el 20 de junio de 1876 con el brevePastoris aeterni del papaPío IX, obteniendo el territorio del vicariato apostólico de Japón (hoy arquidiócesis de Tokio).[1]
El 20 de marzo de 1888 cedió una parte de su territorio para la erección del vicariato apostólico de Japón Central (hoy arquidiócesis de Osaka) mediante el breve Quae rei sacrae del papa León XIII.[2]
El 15 de junio de 1891, como resultado del breve Non maius Nobis del papa León XIII, el vicariato apostólico fue elevado a diócesis y asumió el nombre de diócesis de Nagasaki.[3]
El 18 de marzo de 1927 cedió una parte de su territorio para la erección de la prefectura apostólica de Kagoshima (hoy diócesis de Kagoshima) mediante el breve Aucto pastorum del papa Pío XI.[4]
El 16 de julio de 1927 cedió otra parte de su territorio para la erección de la diócesis de Fukuoka mediante el breve Catholicae Fidei del papa Pío XI.[5]
Durante la Segunda Guerra Mundial la bomba atómica que Estados Unidos lanzó sobre Nagasaki el 9 de agosto de 1945 detonó a tan solo 500 m de la catedral, destruyéndola completamente y matando a todos los católicos congregados en la catedral y a muchos otros en otros sitios de la ciudad. En 1959 fue reconstruida en el mismo lugar imitando su forma original.
Restos de la catedral destruida en 1945
El 4 de mayo de 1959 la diócesis fue elevada al rango de arquidiócesis metropolitana con la bula Qui cotidie del papa Juan XXIII.[6]
Estadísticas
De acuerdo al Anuario Pontificio 2020 la arquidiócesis tenía a fines de 2019 un total de 60 933 fieles bautizados.