La diócesis de Chachapoyas es sufragánea de la arquidiócesis de Piura. Dentro de la provincia eclesiástica de Piura, la diócesis cubre un total de 21 659 km² del departamento de Amazonas.
La diócesis de Chachapoyas se crea mediante la bula Ex sublimi Petri del papa Gregorio XVI del 2 de junio de 1843, en la cual se cambia el nombre de Maynas por el de Chachapoyas. En 1900 se crean los vicariatos de Amazonas y Ucayali a los que se les asignan las misiones del Marañón y del Ucayali, que comprendían lo que hoy es el departamento de Loreto y parte de Pucallpa y Huánuco. En 1948 se separa de la diócesis todo el departamento de San Martín, dando lugar a la prelatura de Moyobamba; y más tarde, cuando se crea el vicariato de Jaén, formado por la provincia de Condorcanqui y parte de Bagua.[1]
En el año 2006, alrededor de 311 000 católicos vivían en la jurisdicción de la Diócesis que incluye cinco provincias (Bagua, Bongará, Chachapoyas, Luya y Rodríguez de Mendoza).
En Amazonas: 5 provincias.
Las parroquias son 24.
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De acuerdo al Anuario Pontificio 2020 la diócesis tenía a fines de 2019 un total de 363 800 fieles bautizados.