El conjunto de jardines alberga una amplia colección botánica, con un buen número de especies, subespecies y rarezas, en la que también destaca su altura y su antigüedad, con ejemplares en torno a los 50 metros de altura y más de 200 años. Así, albergan más de 400 especies arbóreas y arbustivas y acogen 28 árboles catalogados como singulares por la Comunidad de Madrid.[2] Entre estos sobresale un ejemplar llamado Plátano de la Trinidad que, con 220 años de edad y 47 metros de altura, es el árbol más alto de la Comunidad de Madrid.[3]