La Primera División de la República Federal de Yugoslavia en su temporada 1998-99, fue la 7° edición del torneo, en esta participaron clubes de la actual Serbia y de Montenegro,
Debido al Bombardeo de Yugoslavia por las fuerzas de la OTAN, La liga fue suspendida indefinidamente el 14 de mayo de 1999 con 24 fechas disputadas. El día 12 de junio el líder provisorio de la clasificación el club Partizan de Belgrado es declarado oficialmente campeón, que consiguió de esta manera su 16° título en su historia.
Los dieciocho mejores clubes del país participaron en la competición y se agrupan en un único grupo en que se enfrentan dos veces a sus oponentes. Al final de la temporada para permitir la expansión de la primera división de 18 a 22 clubes la próxima temporada, ningún club es relegado y los cuatro mejores equipos de la Segunda Liga son promovidos.
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