Históricamente esta región a estado muy ligada a la vecina región de El Soconusco, formando una unidad durante el periodo colonial como la Gobernación del Soconusco, integrada esta a su vez en la intendencia de Ciudad Real de Chiapas.
Tras la independencia de Chiapas y su sucesiva anexión de la república mexicana el Soconusco quedó en situación de disputa entre la México y república Centroamérica, más tarde sucedida por Guatemala, situación que continuó hasta la firma del tratado de Herrera-Mariscal que ponía fin a los reclamos de Guatemala sobre territorios chiapanecos y fijaba los límites entre México y Guatemala.
Los pueblos de la Sierra Mariscal pasaron a depender políticamente de la diputación de Comitán pero en la práctica se manejaban independientes a esta.
Tras la reorganización regional del estado chiapaneco se reconoció como la unidad social y económica de esta región bajo el nombre oficial de Región XI - Sierra Mariscal.