ژن TCOF1

TCOF1
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگرTCOF1, MFD1, TCS, TCS1, treacle, treacle ribosome biogenesis factor 1
شناسه‌های بیرونیOMIM: 606847; MGI: 892003; HomoloGene: 68049; GeneCards: TCOF1; OMA:TCOF1 - orthologs
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌هاانسانموش
Entrez

6949

21453

Ensembl

ENSG00000070814

ENSMUSG00000024613

UniProt

Q13428

O08784

RefSeq (mRNA)

NM_001198984
NM_011552

RefSeq (پروتئین)

NP_001185913
NP_035682

موقعیت (UCSC)Chr 5: 150.36 – 150.4 MbChr 18: 60.95 – 60.98 Mb
جستجوی PubMed[۳][۴]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسانمشاهده/ویرایش موش

فاکتور بیوژنز ریبوزوم تراکل 1 یا TCOF1 یا Treacle Ribosome Biogenesis Factor 1 که با نام پروتئین تراکل نیز شناخته می شود، پروتئینی است که در انسان توسط ژن TCOF1 کد می شود.[۵][۶] این ژن یک پروتئین هستکی را با یک دامین همولوگ LIS1 کد می کند.[۷] پروتئین تراکل با برهمکنش با فاکتور متصل شونده به بالادست ژن یا UBF در رونویسی ژن های rRNA دخیل است. جهش ها در این ژن با سندروم تریچر کالینز، یک اختلال که با تکوین غیرطبیعی استخوان های جمجمه و صورت همراه است، مرتبط هستند. ترانسکریپت های متنوعی طی پیرایش متناوب از این ژن کد می شوند که تا کنون تنها 3 مورد از آنها شناسایی شده اند.[۶]

ژن

ژن TCOF1 بر روی بازوی بلند (q) کروموزوم 5 و میان نواحی 32 و 33.1 و از نوکلئوتید 150,357,629 تا نوکلئوتید 150,400,308 قرار دارد.[۸] بررسی ها و مطالعات مختلف برروی این ژن توسط محققان از سال 1996، 29 اگزون را برای این ژن شناسایی کرده اند.[۹][۱۰][۱۱] در سال 1996 گروه تحقیقاتی سندروم تریچر کالینز با استفاده از تکنیک های ترکیبی هیبرید تابشی و آنالیز کانتیگ YAC/cosmid نقشه یابی ژن TCOF1 را انجام داده و لوکوس آن را 5q اعلام کردند؛ یک ناحیه غنی از ژن که ژن های دیگری نظیر DTDST، CSF1R، PDGFRB و CDX1 در اطراف آن حضور دارند.[۱۲]

عملکرد

فاکتور TCOF1 در تولید مولکولی بنام RNA ریبوزومی یا rRNA درون سلول ها دخالت دارد.[۷] این پروتئین درون هستک، یک ناحیه کوچک درون هسته سلول که rRNA سنتز می شود، فعال است.[۱۳] بعنوان عضوی از ساختاری مهم و کلیدی درون سلول بنام ریبوزوم، rRNA نقش مهمی را در فرایند ترجمه و سنتز پروتئین ها ایفا می کند.[۱۴] این پروتئین در طول تکوین جنین در ساختارهایی که به استخوان ها و دیگر بافت های صورت تبدیل می شوند، فعال است.[۱۵] با اینکه عملکرد دقیق این پروتئین ناشناخته است، دانشمندان معتقدند که این پروتئین در تکوین استخوان ها و دیگر ساختارهای چهره دخالت دارد.[۱۶]

علاوه بر برهمکنش این پروتئین با فاکتور UBF، پروتئین تراکل همچنین در متیلاسیون RNA ریبوزومی در طی بلوغ آن با برهمکنش با پروتئین هستکی pNop56 نقش دارد.[۱۷]

اهمیت بالینی

بیش از 120 جهش مختلف در ژن TCOF1 در افراد مبتلا به بیماری تریچر کالینز شناسایی شده است. اکثر این جهش ها از نوع درج یا حذف تعدادی جفت باز در این ژن هستند. جهش های مذکور یا باعث تولید پروتئین تراکل غیرطبیعی کوچک و بدون عملکرد می شوند و یا از تولید این پروتئین توسط سلول جلوگیری می کنند. دانشمندان فرض می کنند که کاهش میزان این پروتئین باعث کاهش تولید rRNA در برخی اجزای جنین که به بخش های صورت آن تکوین می یابند، می شود؛ اما همچنان اینکه چگونه اختلال در این ژن باعث ویژگی های چهره ای سندروم تریچر کالینز می شود، ناشناخته است. برای مثال یکی از مهمترین ویژگی های افراد مبتلا به این سندروم طی جهش در TCOF1، شکاف کام است.[۱۸]

ارگانیسم های مدل

مشخص شده است که جهش ها در ژن TCOF1 در نژاد سگ های جیندو (Jindo) دلیل تفاوت های چهره ای این سگ ها با نژاد سگ های باکسر (Boxer) می باشد.[۱۹]

  1. ↑ ۱٫۰ ۱٫۱ ۱٫۲ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000070814 – Ensembl, May 2017
  2. ↑ ۲٫۰ ۲٫۱ ۲٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024613 – Ensembl, May 2017
  3. ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ↑ Wang Jabs, Ethylin; Li, Xiang; Coss, Cathleen A.; Taylor, Eugene W.; Meyers, Deborah A.; Weber, James L. (1991-09). "Mapping the Treacher Collins syndrome locus to 5q31.3→q33.3". Genomics (in English). 11 (1): 193–198. doi:10.1016/0888-7543(91)90118-X. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  6. ↑ ۶٫۰ ۶٫۱ «TCOF1 treacle ribosome biogenesis factor 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. دریافت‌شده در ۲۰۲۵-۰۹-۰۱.{{cite web}}: نگهداری یادکرد:تاریخ به‌طور خودکار ترجمه‌شده (رده)
  7. ↑ ۷٫۰ ۷٫۱ Valdez, Benigno C.; Henning, Dale; So, Rolando B.; Dixon, Jill; Dixon, Michael J. (2004-07-20). "The Treacher Collins syndrome ( TCOF1 ) gene product is involved in ribosomal DNA gene transcription by interacting with upstream binding factor". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 101 (29): 10709–10714. doi:10.1073/pnas.0402492101. ISSN 0027-8424. PMC 489999. PMID 15249688.
  8. ↑ «Chromosome 5: 150,357,629-150,400,308 - Region in detail - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 114». asia.ensembl.org. دریافت‌شده در ۲۰۲۵-۰۹-۰۱.{{cite web}}: نگهداری یادکرد:تاریخ به‌طور خودکار ترجمه‌شده (رده)
  9. ↑ Gladwin, A. (1996-10-01). "Treacher Collins syndrome may result from insertions, deletions or splicing mutations, which introduce a termination codon into the gene". Human Molecular Genetics. 5 (10): 1533–1538. doi:10.1093/hmg/5.10.1533.
  10. ↑ Wise, Carol A.; Chiang, Lydia C.; Paznekas, William A.; Sharma, Mridula; Musy, Maurice M.; Ashley, Jennifer A.; Lovett, Michael; Jabs, Ethylin W. (1997-04). "TCOF1 gene encodes a putative nucleolar phosphoprotein that exhibits mutations in Treacher Collins Syndrome throughout its coding region". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 94 (7): 3110–3115. doi:10.1073/pnas.94.7.3110. ISSN 0027-8424. PMC 20330. PMID 9096354. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  11. ↑ So, Rolando B.; Gonzales, Bianca; Henning, Dale; Dixon, Jill; Dixon, Michael J.; Valdez, Benigno C. (2004-03). "Another face of the Treacher Collins syndrome (TCOF1) gene: identification of additional exons". Gene (in English). 328: 49–57. doi:10.1016/j.gene.2003.11.027. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  12. ↑ The Treacher Collins Syndrome Colla; Dixon, Jill; Edwards, Sara J.; Gladwin, Amanda J.; Dixon, Michael J.; Loftus, Stacie K.; Bonner, Cynthia A.; Koprivnikar, Kathryn; Wasmuth, John J. (1996-02). "Positional cloning of a gene involved in the pathogenesis of Treacher Collins syndrome". Nature Genetics (in English). 12 (2): 130–136. doi:10.1038/ng0296-130. ISSN 1061-4036. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  13. ↑ Wise, Carol A.; Chiang, Lydia C.; Paznekas, William A.; Sharma, Mridula; Musy, Maurice M.; Ashley, Jennifer A.; Lovett, Michael; Jabs, Ethylin W. (1997-04). "TCOF1 gene encodes a putative nucleolar phosphoprotein that exhibits mutations in Treacher Collins Syndrome throughout its coding region". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 94 (7): 3110–3115. doi:10.1073/pnas.94.7.3110. ISSN 0027-8424. PMC 20330. PMID 9096354. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  14. ↑ "Ribosomes, Transcription, Translation | Learn Science at Scitable". www.nature.com (in English). Retrieved 2025-09-01.
  15. ↑ "TCOF1 gene: MedlinePlus Genetics". medlineplus.gov (in English). Retrieved 2025-09-01.
  16. ↑ Dixon, Jill; Jones, Natalie C.; Sandell, Lisa L.; Jayasinghe, Sachintha M.; Crane, Jennifer; Rey, Jean-Philippe; Dixon, Michael J.; Trainor, Paul A. (2006-09-05). "Tcof1 /Treacle is required for neural crest cell formation and proliferation deficiencies that cause craniofacial abnormalities". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 103 (36): 13403–13408. doi:10.1073/pnas.0603730103. ISSN 0027-8424. PMC 1557391. PMID 16938878.
  17. ↑ Gonzales, Bianca; Henning, Dale; So, Rolando B.; Dixon, Jill; Dixon, Michael J.; Valdez, Benigno C. (2005-07-15). "The Treacher Collins syndrome (TCOF1) gene product is involved in pre-rRNA methylation". Human Molecular Genetics (in English). 14 (14): 2035–2043. doi:10.1093/hmg/ddi208. ISSN 1460-2083.
  18. ↑ Dixon, Michael J.; Marazita, Mary L.; Beaty, Terri H.; Murray, Jeffrey C. (2011-03). "Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences". Nature Reviews Genetics (in English). 12 (3): 167–178. doi:10.1038/nrg2933. ISSN 1471-0056. PMC 3086810. PMID 21331089. {{cite journal}}: تاریخ وارد شده در |date= را بررسی کنید (کمک)
  19. ↑ Kim, R. N.; Kim, D.-S.; Choi, S.-H.; Yoon, B.-H.; Kang, A.; Nam, S.-H.; Kim, D.-W.; Kim, J.-J.; Ha, J.-H. (2012-06-01). "Genome Analysis of the Domestic Dog (Korean Jindo) by Massively Parallel Sequencing". DNA Research (in English). 19 (3): 275–288. doi:10.1093/dnares/dss011. ISSN 1340-2838. PMC 3372376. PMID 22474061.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.