Rhofactor
De rhofactor (ρ-factor) is een eiwit dat in prokaryoten de RNA-transcriptie kan beëindigen. Het reageert als een ATP-afhankelijke helicase, die langs een nieuw gevormde RNA-streng richting het 3'-eind beweegt en ten slotte ervoor zorgt dat het RNA van het DNA loslaat.[1]
Bij Escherichia coli is de rhofactor een ca. 275 kDa zwaar hexameer dat uit zes dezelfde subeenheden bestaat, waarvan elke subeenheid een RNA-bindend en een ATP-bindend eiwitmotief heeft. De subeenheden zijn rondom een holle ruimte gerangschikt, waar de RNA-streng doorheen gevoerd wordt. De rho-factor bindt aan de transcriptie-terminator-pauzeplaats. Deze plaats is een enkelstrengs RNA, dat 72 nucleotiden lang is en achter de open leesraam ligt. Het is een C-rijke/G-arme (cytosine-rijke/guanine-arme) sequentie zonder secundaire structuur.[2] Vanaf deze plaats gaat het enzym onder verbruik van ATP naar de transcriptieplaats, waar het RNA door de RNA-polymerase gevormd wordt. De rhofactor werkt op deze plaats als een helicase. Daardoor wordt de vorming van de RNA-streng beëindigd.[3][4]
De bindingsplaats (rho utilization site) zit boven het transcriptie-eind. Er zijn verschillende bindingsplaatsen gevonden.
Literatuur
- Banerjee S, Chalissery J, Bandey I, Sen R (February 2006). Rho-dependent transcription termination: more questions than answers. J. Microbiol. 44 (1): 11–22. PMID 16554712. PMC 1838574.
Zie ook
- ↑ Interpro: IPR011113 Rho termination factor, RNA-binding
- ↑ Slonczewski, Joan, and John Watkins. Foster. Microbiology: An Evolving Science. New York: W.W. Norton &, 2009. Print.
- ↑ Bogden CE, Fass D, Bergman N, Nichols MD, Berger JM (April 1999). The structural basis for terminator recognition by the Rho transcription termination factor. Mol. Cell 3 (4): 487–93. PMID 10230401.
- ↑ Richardson JP (July 2003). Loading Rho to terminate transcription. Cell 114 (2): 157–9. PMID 12887917.
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.