NMD

NMD (ang. Nonsense-Mediated Decay) – zachodzące w komórkach organizmów eukariotycznych zjawisko polegające na rozpoznawaniu i niszczeniu mRNA zawierających przedwczesny kodon STOP (PTC, ang. premature termination codon). Taki „proces kontroli jakości” mRNA zapobiega powstawaniu skróconych białek, które mogą być szkodliwe dla komórki. Proces NMD jest też wykorzystywany w komórce do regulacji ekspresji niektórych potrzebnych białek[1]. Rozpoznawanie przedwczesnych kodonów STOP jest powiązane z procesami splicingu i translacji[2][3].

NMD u drożdży

U drożdży Saccharomyces cerevisiae NMD zachodzi w cytoplazmie podczas translacji. Do rozpoznania przedwczesnego kodonu STOP potrzebna jest położona w kierunku 3' od kodonu STOP sekwencja DSE (ang. downstream destabilizing element). Kiedy rybosom podczas translacji zatrzymuje się na kodonie STOP, wiąże się z nim kompleks białkowy zawierający eukariotyczne czynniki uwalniające (eRF) i białka Upf. Jeśli wykryją one położoną niedaleko sekwencję DSE, rozpoczyna się degradacja mRNA.

NMD u ssaków

U ssaków kodon STOP jest rozpoznawany jako przedwczesny, jeśli znajduje się co najmniej 55 nukleotydów w kierunku 5' od miejsca łączenia egzonów. Po splicingu zostaje tam kompleks białkowy zawierający m.in. białka zaangażowane w kierowanie mRNA zawierających PTC do degradacji.

Zastosowania w medycynie

Prowadzone są badania nad lekami umożliwiającymi przechodzenie rybosomu przez przedwczesny kodon STOP i syntezę białek o pełnej długości. Takie leki mogą znaleźć zastosowanie w terapii chorób genetycznych spowodowanych mutacjami punktowymi wprowadzającymi przedwczesny kodon STOP, np. mukowiscydozy czy dystrofii mięśniowej Duchenne’a[4]

Przypisy

  1. ↑ Corinna Giorgi i inni, The EJC factor eIF4AIII modulates synaptic strength and neuronal protein expression, „Cell”, 130 (1), 2007, s. 179-91, DOI: 10.1016/j.cell.2007.05.028, PMID: 17632064.
  2. ↑ Pamela A. Frischmeyer, Harry C. Dietz, Nonsense-mediated mRNA decay in health and disease, „Human Molecular Genetics”, 8 (10), 1999, s. 1893-1900, DOI: 10.1093/hmg/8.10.1893 [zarchiwizowane z adresu 2012-07-12].
  3. ↑ Joachim Weischenfeldt, Jens Lykke-Andersen, Bo Porse, Messenger RNA surveillance: neutralizing natural nonsense, „Current Biology”, 15 (14), 2005, R559-62, DOI: 10.1016/j.cub.2005.07.002, PMID: 16051166.
  4. ↑ Ellen M. Welch i inni, PTC124 targets genetic disorders caused by nonsense mutations, „Nature”, 2007, DOI: 10.1038/nature05756, PMID: 17450125.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.