ARNT

ARNT
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2

Идентификаторы
ПсевдонимыARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Внешние IDOMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме ARNT
Расположение в геноме ARNT
Локус1q21.3Начало150,809,713 bp[1]
Конец150,876,708 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме ARNT
Расположение в геноме ARNT
Локус3 F2.1|3 40.74 cMНачало95,341,699 bp[2]
Конец95,404,551 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • epithelium of colon

  • sural nerve

  • stromal cell of endometrium

  • ectocervix

  • body of uterus
Наибольшая экспрессия в
  • muscle of thigh

  • cumulus cell
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

405

11863

Ensembl

ENSG00000143437

ENSMUSG00000015522

UniProt

P27540

P53762

RefSeq (мРНК)
NM_001197325
NM_001286035
NM_001286036
NM_001668
NM_178426

NM_178427
NM_001350224
NM_001350225
NM_001350226

NM_001037737
NM_009709

RefSeq (белок)
NP_001184254
NP_001272964
NP_001272965
NP_001659
NP_848514

NP_001337153
NP_001337154
NP_001337155

NP_001032826
NP_033839

Локус (UCSC)Chr 1: 150.81 – 150.88 MbChr 3: 95.34 – 95.4 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы[5].

Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.

Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.

Взаимодействия с другими белками

ARNT взаимодействует со следующими белками:

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
  6. ↑ Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]
  7. ↑ Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.
  8. ↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.
  9. ↑ Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.
  10. ↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.
  11. ↑ Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology[англ.] : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.
  12. ↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.
  13. ↑ 1 2 Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.
  14. ↑ 1 2 3 Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.
  15. ↑ 1 2 Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.
  16. ↑ 1 2 Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.
  17. ↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.
  18. ↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.