Jmol
| Jmol | |||
|---|---|---|---|
mol_logo_2013.svg){kind=logo} | |||
 Jmol — Java программа для визуализации трёхмерных молекулярных структур | |||
| Тип | Биоинформатика | ||
| Разработчик | Команда разработчиков Jmol | ||
| Написана на | Java | ||
| Операционная система | Кроссплатформенный | ||
| Языки интерфейса | каталанский, китайский, чешский, немецкий, английский, французский, нидерландский, венгерский, итальянский, корейский, португальский, испанский, турецкий, русский | ||
| Аппаратная платформа | Java Virtual Machine | ||
| Последняя версия | 16.1.9 (23 марта 2023) | ||
| Репозиторий | sourceforge.net/p/jmol/c… | ||
| |||
| Лицензия | LGPL | ||
| Сайт | jmol.org | ||
 Медиафайлы на Викискладе | |||
Jmol — программа для просмотра структуры молекул в трёх измерениях.
Jmol используется как для учебных целей[2], так и при проведении научных исследований в области молекулярной биологии, химии и биохимии. Программа является свободной и открытой. Она написана на языке Java и потому является кроссплатформенной. Существует как отдельная программа, так и средства для интеграции в другое Java-приложение. Чаще всего программа используется как аплет, встраиваемый в веб-страницу. Программа позволяет строить изображения молекул несколькими способами. Jmol поддерживает большое количество форматов файлов, включая:
- Protein Data Bank (pdb)
- Crystallographic Information File (cif)
- MDL Molfile (mol)
- Chemical Markup Language (CML)
- Chemical File Format (XYZ).
Скриншоты
-
Кристаллическая структура H/ACA коробки RNP из архебактерии Pyrococcus furiosus. -
Подсвечивание двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемо-группа изображена палочками в нижнем правом углу). -
Фрагмент транскрипционного фактора TFIIIA, образующего три последовательных цинковых пальца, присоединённых к последовательности ДНК. -
Ссылки
См. также
Примечания
- ↑ Willighagen E. Processing CML conventions in Java (англ.) // Internet Journal of Chemistry — 2001. — Vol. 4, Iss. 4. — 9 p. — ISSN 1099-8292 — doi:10.5281/ZENODO.1495470
- ↑ A. Herraez. Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue (англ.) // Biochemistry and Molecular Biology Education. — 2006. — Vol. 34, no. 4. — P. 7. Архивировано 31 мая 2020 года.
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.