LINEs

LINEs (англ. Long interspersed nuclear element, Длинные Диспергированные Повторы[1]) — длинные (несколько тысяч пар оснований[2]) последовательности ДНК в геноме эукариот, представляющие собой ретротранспозоны, не содержащие длинных концевых повторов.

Первое описание LINE-последовательности, длиной около 6 400 пар оснований, было опубликовано в 1980 году.[3]

Строение

На 3'-конце LINEs содержат либо поли(A)-хвост, либо аденин богатую последовательность, либо тандемно-повторяющиеся последовательности. LINEs содержат одну или две открытые рамки считывания[4].

Выделяют 5 суперсемейств LINEs[4]:

  • R2. Содержат одну открытую рамку считывания, которая кодирует обратную транскриптазу и эндонуклеазу. Считается, что это наиболее древнее семейство ретропозонов не содержащих длинных концевых повторов.
  • RTE. Также содержат одну открытую рамку считывания, кодирующую апуриновую-апуримидиновую эндонуклеазу и обратную транскриптазу.

Три других суперсемейства содержат две открытые рамки считывания. Продукт первой (ORF1) из которых, кодирует белок по свойствам похожий на продукт гена gag ретровирусов.

  • Jockey. Вторая открытая рамка считывания (ORF2) кодирует апуриновую-апуримидиновую эндонуклеазу и обратную транскриптазу.
  • L1. ORF2 кодирует те же элементы, что и у суперсемейства Jockey. LINEs этого суперсемейства являются наиболее изученными и наиболее распространенными в геноме млекопитающих. Так в геноме человека содержится более 500 тыс. копий ретропозонов LINE-1, что составляет около 17 % генома.
  • I. ORF2 кроме апуриновой-апуримидиновой эндонуклеазы и обратной транскриптазы кодирует также и РНКазу H.

См. также

Примечания

  1. ↑ Singer M. F. SINEs and LINEs: highly repeated short and long interspersed sequences in mammalian genomes. (англ.) // Cell. — 1982. — Vol. 28, no. 3. — P. 433—434. — PMID 6280868. [исправить]
  2. ↑ Антонио Лима-де-Фариа. Похвала «глупости» хромосомы: исповедь непокорной молекулы. — Москва: Бином. Лаборатория знаний, 2012. — С. 275. — 312 с. — ISBN 978-5-9963-0974-0.
  3. ↑ Adams, J. W., Kaufman, R. E., Kretschmer, P. J., Harrison, M., Nienhuis, A. W. A family of long reiterated DNA sequences, one copy of which is next to the human beta globin gene // Nucleic Acids Research : журнал. — 1980. — Т. 8, № 24. — С. 6113. — doi:10.1093/nar/8.24.6113.
  4. ↑ 1 2 López-Flores I., Garrido-Ramos M. A. The repetitive DNA content of eukaryotic genomes // Garrido-Ramos M.A. Genome Dynamics. — 2012. — Т. 7. — С. 1-28. — ISBN 978-3-318-02149-3. — doi:10.1159/isbn.978-3-318-02150-9.
Цинковый палец
Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Помогите Википедии, дополнив её.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.