MBD3

Белок метил-CpG связывающего домена 3
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2MB7

Идентификаторы
Символ MBD3
Внешние ID OMIM: 603573 MGI: 1333812 HomoloGene: 2917 GeneCards: Ген MBD3
Генная онтология
Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding

• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding
• DNA binding
• protein binding
• methyl-CpG binding

• nucleosomal DNA binding
Компонент клетки • nuclear chromatin

• heterochromatin
• cytoplasm
• NuRD complex

• protein complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• in utero embryonic development
• methylation-dependent chromatin silencing
• transcription, DNA-templated
• tissue development
• histone acetylation

• ATP-dependent chromatin remodeling
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 53615 17192
Ensembl ENSG00000071655 ENSMUSG00000035478
UniProt O95983 Q9Z2D8
RefSeq (мРНК) NM_001281453 NM_013595
RefSeq (белок) NP_001268382 NP_038623
Локус (UCSC) Chr 19:
1.58 – 1.59 Mb		 Chr 10:
80.39 – 80.4 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Белок метил-CpG-связывающего домена 3 — белок, кодируемый у человека геном MBD3[1][2][3].

Функция

Метилирование ДНК является основной модификацией генома эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 относятся к семейству ядерных белков, объединённых по признаку наличия метил-CpG связывающего домена[англ.]. Однако, в отличие от других членов семейства, MBD3 не способен связываться с метилированной ДНК, но вместо этого связывается с гидроксиметилированной ДНК [1]. Первичная структура MBD3 на 71 % и 94 % идентична структуре MBD2 (изоформа1) и мышиному Mbd3. MBD3 является субъединицей мультисубъединичного комплекса NuRD, способный модифицировать нуклеосомы и обладающего гистондеацетилазной активностью. MBD3 опосредует связывания метастаз-ассоциироованного белка 2 (MTA2) с ядром гистондеацетилазного комплекса[3].

MBD3 также содержит домен спиральной катушки (coiled-coil), общий для всех трех известных изоформ MBD3. Именно домен спиральной катушки, а не MBD домен, помогает поддерживать плюрипотентность эмбриональных стволовых клеток, направляя поликомб репрессорный комплекс 2 (PRC2) на подмножества генов, связанных с развитием и органогенезом, тем самым поддерживая их стабильную репрессию[4].

Взаимодействия

MBD3,как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

  1. ↑ Hendrich B., Bird A. Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1998. — November (vol. 18, no. 11). — P. 6538—6547. — PMID 9774669. — PMC 109239.
  2. ↑ Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes (англ.) // Mamm Genome[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 10, no. 9). — P. 906—912. — doi:10.1007/s003359901112. — PMID 10441743.
  3. ↑ 1 2 Entrez Gene: MBD3 methyl-CpG binding domain protein 3.
  4. ↑ Hirasaki, M., Ueda, A., Asaka, M. N., Uranishi, K., Suzuki, A., Kohda, M., ... & Koseki, H. (2018). Identification of the Coiled‐Coil Domain as an Essential Mbd3 Element for Preserving Lineage Commitment Potential of Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. doi:10.1002/stem.2849
  5. ↑ 1 2 3 Sakai H., Urano T., Ookata K., Kim M.H., Hirai Y., Saito M., Nojima Y., Ishikawa F. MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 50. — P. 48714—48723. — doi:10.1074/jbc.M208461200. — PMID 12354758.
  6. ↑ Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.
  7. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2. — P. 536—546. — doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
  8. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  9. ↑ 1 2 Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
  10. ↑ Jiang C.L., Jin S.G., Pfeifer G.P. MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 50. — P. 52456—52464. — doi:10.1074/jbc.M409149200. — PMID 15456747.

Литература

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.