NAIP

NAIP
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2VM5

Идентификаторы
ПсевдонимыNAIP, BIRC1, NLRB1, psiNLR family, apoptosis inhibitory protein, NLR family apoptosis inhibitory protein
Внешние IDOMIM: 600355 MGI: 1298226 HomoloGene: 136092 GeneCards: NAIP
Расположение гена (человек)
5-я хромосома человека
Хр.5-я хромосома человека[1]
5-я хромосома человека
Расположение в геноме NAIP
Расположение в геноме NAIP
Локус5q13.2Начало70,968,166 bp[1]
Конец71,025,339 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
13-я хромосома мыши
Хр.13-я хромосома мыши[2]
13-я хромосома мыши
Расположение в геноме NAIP
Расположение в геноме NAIP
Локус13 D1|13 53.01 cMНачало100,280,571 bp[2]
Конец100,338,600 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004536
NM_022892
NM_001346870

NM_001126182
NM_010872

RefSeq (белок)

NP_001333799
NP_004527
NP_075043

NP_001119654
NP_035002

Локус (UCSC)Chr 5: 70.97 – 71.03 MbChr 13: 100.28 – 100.34 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

NAIP (англ. NLR family, apoptosis inhibitory protein) — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор, продукт гена NAIP, ингибирует апоптоз.

Функции

NAIP является анти-апоптозным белком, ингибирует каспазы 3, 7 и 9. Может ингибировать как аутопротеолиз прокаспазы-9, так и активирующий протеолиз прокаспазы-3 под действием каспазы-9. Играет роль медиатора выживания нейрональных клеток в патологических условиях, предотвращает апоптоз моторных нейронов, вызванный различными сигналами. Различные мутации белка были обнаружены у больных с тяжёлой спинальной мышечной атрофией.

Структура

NLRC5 — крупный белок, состоит из 1403 аминокислот, молекулярная масса — 159,6 кДа. Молекула включает 3 BIR-повтора, NACHT-домен с участком связывания АТФ и 4 цистеиновых участков связываний цинка в 3-м BIR-домене.

Взаимодействует с APAF1 через NACHT-домен.[5]

Тканевая специфичность

Экспрессируется в моторных нейронах, но отсутствует в сенсорных нейронах. Присутствует в печени, плаценте, в меньшей степени — в спинном мозге.

Примечания

  1. 1 2 3 ENSG00000276068, ENSG00000249437 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278613, ENSG00000276068, ENSG00000249437 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000078945 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. UniProt Q13075. Дата обращения: 22 мая 2012. Архивировано 29 августа 2017 года.

Литература

  • van der Steege G., Draaijers T. G., Grootscholten P. M., et al. A provisional transcript map of the spinal muscular atrophy (SMA) critical region. (англ.) // Eur. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 3, no. 2. — P. 87—95. — PMID 7552146.
  • Liston P., Roy N., Tamai K., et al. Suppression of apoptosis in mammalian cells by NAIP and a related family of IAP genes. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 379, no. 6563. — P. 349—353. — doi:10.1038/379349a0. — PMID 8552191.
  • Chen Q., Baird S. D., Mahadevan M., et al. Sequence of a 131-kb region of 5q13.1 containing the spinal muscular atrophy candidate genes SMN and NAIP. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 48, no. 1. — P. 121—127. — doi:10.1006/geno.1997.5141. — PMID 9503025.
  • Monani U. R., Lorson C. L., Parsons D. W., et al. A single nucleotide difference that alters splicing patterns distinguishes the SMA gene SMN1 from the copy gene SMN2. (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 1999. — Vol. 8, no. 7. — P. 1177—1183. — doi:10.1093/hmg/8.7.1177. — PMID 10369862.
  • Yamamoto K., Sakai H., Hadano S., et al. Identification of two distinct transcripts for the neuronal apoptosis inhibitory protein gene. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 1999. — Vol. 264, no. 3. — P. 998—1006. — doi:10.1006/bbrc.1999.1615. — PMID 10544044.
  • Mercer E. A., Korhonen L., Skoglösa Y., et al. NAIP interacts with hippocalcin and protects neurons against calcium-induced cell death through caspase-3-dependent and -independent pathways. (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 14. — P. 3597—3607. — doi:10.1093/emboj/19.14.3597. — PMID 10899114. — PMC 313967.
  • Sanna M. G., da Silva Correia J., Ducrey O., et al. IAP suppression of apoptosis involves distinct mechanisms: the TAK1/JNK1 signaling cascade and caspase inhibition. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 6. — P. 1754—1766. — doi:10.1128/MCB.22.6.1754-1766.2002. — PMID 11865055. — PMC 135597.
  • Akutsu T., Nishio H., Sumino K., et al. Molecular genetics of spinal muscular atrophy: contribution of the NAIP gene to clinical severity. (англ.) // The Kobe journal of medical sciences : journal. — 2002. — Vol. 48, no. 1—2. — P. 25—31. — PMID 11912351.
  • Xu M., Okada T., Sakai H., et al. Functional human NAIP promoter transcription regulatory elements for the NAIP and PsiNAIP genes. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 1574, no. 1. — P. 35—50. — doi:10.1016/S0167-4781(01)00343-8. — PMID 11955612.
  • Notarbartolo M., Cervello M., Dusonchet L., D'Alessandro N. NAIP-deltaEx10-11: a novel splice variant of the apoptosis inhibitor NAIP differently expressed in drug-sensitive and multidrug-resistant HL60 leukemia cells. (англ.) // Leuk. Res.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 26, no. 9. — P. 857—862. — doi:10.1016/S0145-2126(02)00016-4. — PMID 12127562.
  • Lindholm D., Mercer E. A., Yu L. Y., et al. Neuronal apoptosis inhibitory protein: Structural requirements for hippocalcin binding and effects on survival of NGF-dependent sympathetic neurons. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 1600, no. 1—2. — P. 138—147. — doi:10.1016/S1570-9639(02)00454-5. — PMID 12445469.
  • Damiano J. S., Oliveira V., Welsh K., Reed J. C. Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. (англ.) // Biochem. J.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 381, no. Pt 1. — P. 213—219. — doi:10.1042/BJ20031506. — PMID 15107016. — PMC 1133779.
  • Davoodi J., Lin L., Kelly J., et al. Neuronal apoptosis-inhibitory protein does not interact with Smac and requires ATP to bind caspase-9. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 39. — P. 40622—40628. — doi:10.1074/jbc.M405963200. — PMID 15280366.
  • Aubin D., Gagnon A., Grunder L., et al. Adipogenic and antiapoptotic protein levels in human adipose stromal cells after weight loss. (англ.) // Obes. Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 12, no. 8. — P. 1231—1234. — doi:10.1038/oby.2004.156. — PMID 15340105.
  • Schmutz J., Martin J., Terry A., et al. The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 5. (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 431, no. 7006. — P. 268—274. — doi:10.1038/nature02919. — PMID 15372022.
  • Romanish M. T., Lock W. M., van de Lagemaat L. N., et al. Repeated recruitment of LTR retrotransposons as promoters by the anti-apoptotic locus NAIP during mammalian evolution. (англ.) // PLoS Genet.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 3, no. 1. — P. e10. — doi:10.1371/journal.pgen.0030010. — PMID 17222062. — PMC 1781489.
  • Maier J. K., Balabanian S., Coffill C. R., et al. Distribution of neuronal apoptosis inhibitory protein in human tissues. (англ.) // J. Histochem. Cytochem.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 55, no. 9. — P. 911—923. — doi:10.1369/jhc.6A7144.2007. — PMID 17510375.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.