ShRNA

Малые РНК, образующие шпильки, или кшРНК (короткие РНК, образующие шпильки англ. shRNA, small hairpin RNA, short hairpin RNA) — короткие молекулы рибонуклеиновых кислот, образующие во вторичной структуре плотные шпильки (структуры типа «стебель-петля»). ShRNA могут быть использованы для подавления экспрессии генов путём РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи векторов, в которых кодирующие их последовательности находятся под контролем конститутивно активных (таких как U6) или индуцируемых промоторов. Такие векторы, как правило, содержат последовательности нуклеотидов, которые позволяют им интегрироваться в геном клетки и тем самым обеспечивать наследуемое подавление экспрессии целевого гена[1].

Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК-полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК-полимеразой II[2].

После завершения транскрипции малые РНК, образующие шпильки, разрезаются клеточными ферментами с образованием малых интерферирующих РНК (англ. siRNA). Малые интерферирующие РНК входят в состав РНК-индуцируемого комплекса выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается с мРНК, участки которых комплементарны siRNA, и разрезает их.

Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. В таком случае традиционно используют конститувно активный промотор CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (англ. cauliflower mosaic virus 35S promoter)[3].

Примечания

  1. ↑ Paddison P., Caudy A., Bernstein E., Hannon G., Conklin D. Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 8. — P. 948—958. — doi:10.1101/gad.981002. — PMID 11959843. Архивировано 27 сентября 2007 года.
  2. ↑ Cao W., Hunter R., Strnatka D., McQueen C., Erickson R. DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response (англ.) // J. Appl. Genet. : journal. — 2005. — Vol. 46, no. 2. — P. 217—225. — PMID 15876690. Архивировано 27 ноября 2020 года.
  3. ↑ McIntyre G., Fanning G. Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors (недоступная ссылка — история) (англ.) // BMC Biotechnol. : journal. — 2006. — Vol. 6. — P. 1. — doi:10.1186/1472-6750-6-1. — PMID 16396676.
Цинковый палец
Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Помогите Википедии, дополнив её.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.