ENCODE

ENCODE
Sadržaj
OpisBaza podataka celog genoma
Kontakt
Istraživački
centar		Kalifornijski univerzitet Santa Kruz
LaboratorijaCenter za biomolekularne nauke i inženjestvo
AutoriBrian J Raney[1]
Primarni izvorPMID 21037257
Pristup
Veb-sajtencodeproject.org

Enciklopedija DNK elemenata (ENCODE) je javni istraživački konzorcijum[2] koji je uspostavio USA|američki Nacionalni istraživački institut ljudskog genoma (NHGRI) septembra 2003.[1][3][4][5] Njegov primarni cilj je da se nađu svi funkcionalni elementi ljudskog genoma.[6] Podaci generisani u okviru ovog projekta se deponuju u javne baze podataka.

Inicijalni rezultati projekta su objavljeni 5. septembra 2012. u koordiniranoj grupi od 30 članaka objavljenih u žurnalima Nature (6 publikacija), Genome Biology (18 publikacija), i Genome Research (6 publikacija).[7][8] U publikaciji sa pregledom projekta se navodi da su poznate biohemijske funkcije za 80% ljudskog genoma.[9][10] Znatan deo funkcionalne nekodirajuće DNK učestvuje u regulaciji ekspresije kodirajućih gena.[9] Izražavanje kodirajućih gena je kontrolisano višestrukim rebulatornim mestima, koja mogu da budu locirana u blizini ili na znatnoj razdaljini od gena. Ovi resultati demonstriraju da je regulacija gena daleko kompleksnija nego što se ranije verovalo.[11]

Reference

  1. ^ а б Raney, BJ; Cline, MS; Rosenbloom, KR; Dreszer, TR; Learned, K; Barber, GP; Meyer, LR; Sloan, CA; Malladi, VS; Roskin KM; Suh BB; Hinrichs AS; Clawson H; Zweig AS; Kirkup V; Fujita PA; Rhead B; Smith KE; Pohl A; Kuhn RM; Karolchik D; Haussler D; Jim Kent (2011). „ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update)”. Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D871—5. PMC 3013645 Слободан приступ. PMID 21037257. doi:10.1093/nar/gkq1017. 
  2. ^ Maher, B. (2012). „ENCODE: The human encyclopaedia”. Nature. 489 (7414): 46—8. PMID 22962707. doi:10.1038/489046a. 
  3. ^ ENCODE Project Consortium (2011). Becker PB, ур. „A User's Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)”. PLOS Biology. 9 (4): e1001046. PMC 3079585 Слободан приступ. PMID 21526222. doi:10.1371/journal.pbio.1001046 Слободан приступ. 
  4. ^ Consortium, ENCODE Project; Birney, Ewan; Stamatoyannopoulos, JA; Dutta, A; Guigó, R; Gingeras, TR; Margulies, EH; Weng, Z; Snyder, M; Dermitzakis ET; et al. (2007). „Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project”. Nature. 447 (7146): 799—816. Bibcode:2007Natur.447..799B. PMC 2212820 Слободан приступ. PMID 17571346. doi:10.1038/nature05874. 
  5. ^ Guigó, R; Flicek, P; Abril, JF; Reymond, A; Lagarde, J; Denoeud, F; Antonarakis, S; Ashburner, M; Bajic, VB; Ewan Birney; Castelo R; Eyras E; Ucla C; Gingeras TR; Harrow J; Hubbard T; Lewis SE; Reese MG (2006). „EGASP: The human ENCODE Genome Annotation Assessment Project”. Genome Biology. 7 (Suppl 1): S2.1—31. PMC 1810551 Слободан приступ. PMID 16925836. doi:10.1186/gb-2006-7-s1-s2 Слободан приступ. 
  6. ^ National Human Genome Research Institute. „The ENCODE Project: ENCyclopedia Of DNA Elements”. U.S. National Institutes of Health. 
  7. ^ „ENCODE project at UCSC”. ENCODE Consortium. Приступљено 5. 9. 2012. 
  8. ^ Walsh, F. (5. 9. 2012). „Detailed map of genome function”. BBC News. Архивирано из оригинала 05. 09. 2012. г. Приступљено 6. 9. 2012. 
  9. ^ а б Bernstein BE, Birney E, Dunham I, Green ED, Gunter C, Snyder M (2012). „An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome”. Nature. 489 (7414): 57—74. Bibcode:2012Natur.489...57T. PMC 3439153 Слободан приступ. PMID 22955616. doi:10.1038/nature11247. 
  10. ^ Timmer, J. (10. 9. 2012). „Most of what you read was wrong: how press releases rewrote scientific history”. Staff / From the Minds of Ars. Ars Technica. Приступљено 10. 9. 2012. 
  11. ^ Pennisi, E. (2012). „Genomics. ENCODE project writes eulogy for junk DNA”. Science. 337 (6099): 1159, 1161. PMID 22955811. doi:10.1126/science.337.6099.1159. 

Vidi još

Spoljašnje veze

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.